Congrès annuel 2010
Le 23e Congrès annuel de la Fédération s'est tenu le 8 et 9 mai 2010 à Trois-Rivières. La FMEQ a reçu ses interlocuteurs des Fédérations médicales du Québec, des facultés et du Ministère pour présenter les conclusions du Sondage médical étudiant de la FMEQ. Les facteurs décisionnels derrière le choix de la médecine de famille comme résidence et derrière le choix du Québec comme lieu de pratique ont été explicités. Le Congrès a aussi été l'opportunité de mettre la valorisation de la médecine de famille, l'obtention d'une représentation du Québec et le bien-être étudiant parmi les priorités de l'exercice 2010-2011.
Congrès annuel 2009
Le 9 mai 2009 à Sherbrooke a eu lieu le 22e Congrès annuel de la FMEQ. Les délégués des quatre associations d'étudiants en médecine du Québec en ont profité pour renouveler leur Cahier des positions qui fait état des décisions de la Fédération. Le Congrès a aussi été le théâtre de discussions sur l'avenir de l'éducation médicale en lien avec le projet de l'AFMC du Futur de l'éducation médicale au Canada.
Congrès annuel 2008
Du 19 au 21 septembre s'est tenu le 21e Congrès annuel de la Fédération à Montréal. La FMEQ orchestrait alors ses activités pour la première fois selon ses nouveaux Règlements généraux adoptés en mai 2008. Ce Congrès a été pour les étudiants en médecine un haut lieu de discussions sur la planification des effectifs médicaux au Québec et leurs impacts sur l'éducation médicale. Un panel regroupant des représentants du Ministère de la Santé, de la FMOQ et de la FMSQ sont venu en débattre. Les futurs médecins ont aussi déterminé leurs priorités de l'année : la distribution des postes de résidence entre la médecine de famille et les spécialités, l'amélioration de la visibilité interne ainsi que le suivi des effets de la hausse des admisssions.
Congrès spécial mai 2008
Le 3 mai 2008 a eu lieu le Congrès spécial de la FMEQ qui marquait l'adoption de nouveaux règlements généraux de la FMEQ. La nouvelle charte réorganisait les activités de la Fédération en quatre instances, soit le Congrès, le Conseil général, le Conseil exécutif et le Conseil d'administration.
Congrès annuel 2007
Les 14, 15 et 16 septembre 2007 s'est tenu le 20e Congrès annuel de la FMEQ à l'Hôtel du Roy à Trois-Rivières. On y a discuté des sujets chauds comme les hausses d'admission en médecine, la représentativité canadienne, ainsi que l'accessibilité aux études médicales en termes de frais afférents et du dossier du gel des frais de scolarité. Les projets des Core Competencies et des mini-entrevues multilples ont aussi été expliqués. Les membres du Congrès se sont exprimés sur ce que devraient être les priorités de la fédération pendant l'année à venir. Les sujets retenus sont notamment la réforme des règlements généraux, le développement d'une nouvelle politique des commandites, la représentativité canadienne, la hausse des frais de scolarité, etc. Cette rencontre a aussi donné l'occasion aux quatre facultés de médecine du Québec de faire un retour sur l'année 2006-2007, dont le conflit opposant la FMSQ au MSSS a été un événement marquant.
Congrès annuel 2006
Le Congrès annuel 2006 de la FMEQ s'est tenu les 22, 23 et 24 septembre à l'Hôtel Dauphin, à Drummondville. Les participants ont discuté de sujets variés allant de la participation des universités québécoise au CaRMS à la qualité de la formation médicale, en passant par la féminisation de la médecine, les PREMs, la difficulté d'adaptation chez les professionnels de la santé, etc. On y a aussi adopté la charte d'IFMSA-Qc.
Congrès annuel 2005
Les 16, 17 et 18 septembre 2005 a eu lieu à l'hôtel des Gouverneurs de Trois-Rivières le 18e Congrès annuel de la FMEQ. L'arrivée de campus satellites [Trois-Rivières (2004), Moncton (2006) Chicoutimi (2006)] et l'externat en région furent des sujets débattus par les quelque quarante personnes représentant les quatre facultés de médecine du Québec. L'édition 2005 fut un vif succès et l'année 2005-2006 s'annonce remplie de projets et de travaux prometteurs pour le nouvel exécutif élu lors du congrès.
Congrès annuel 2004
Drummondville fut en septembre 2004 l'hôte du Congrès annuel de la FMEQ sous le thème des grands défis médicaux du 21ème siècle. Au menu : des représentants du Ministère de la Santé et des services sociaux, de la FMSQ, de la FMOQ ainsi que de la FMRQ, qui sont venus débattre leurs idées et opinions sur différents sujets.
Congrès annuel 2003
Le Congrès annuel de la FMEQ de septembre 2003 a eu lieu à l'Auberge du Faubourg à St-Jean-Port-Joli. Sous le thème de la « Gestions de crise », une quarantaine de délégués ont discuté des projets accomplis au cours de la dernière année par la FMEQ, en plus de tracer les grandes lignes pour le mandat à venir. Ce fut une occasion unique pour les différentes associations étudiantes d'échanger sur les grandes préoccupations de l'actualité médicale au Québec.