Fondée en 1974 sous le nom de Fédération des associations étudiantes en médecine du Québec (FAEMQ), la mission primaire de la Fédération médicale étudiante du Québec (FMEQ) a toujours été d’unir les quatre facultés de médecine du Québec de telle sorte à promouvoir et à défendre les intérêts collectifs spécifiques aux étudiants en médecine du Québec en matière pédagogique, politique et sociale. La FMEQ a aussi la mission de favoriser la communication et la collaboration entre les associations membres et leurs membres. En dernier lieu, la FMEQ a aussi comme tierce mission de fournir des services aux membres associatifs et individuels.

La FMEQ est aujourd'hui constituée de plus de 3700 membres en cours d'étude au doctorat de médecine (MD), et une trentaine d'eux sont activement impliqués dans le fonctionnement de la Fédération.

Mot de bienvenue du président 2010-2011, Quoc Dinh Nguyen